在定量PCR時，我們常常糾結一個問題，究竟是相對定量還是絕對定量呢？如今，你無需糾結了，因為數(shù)字PCR（digital PCR）來了。盡管這兩種技術有些類似，都是估計起始樣品中的核酸量，但它們有一個重要的區(qū)別。定量PCR是依靠標準曲線或參照基因來測定核酸量，而數(shù)字PCR則讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個數(shù)，是對起始樣品的絕對定量。因此特別適用于依靠Ct值不能很好分辨的應用領域：拷貝數(shù)變異、突變檢測、基因相對表達研究（如等位基因不平衡表達）、二代測序結果驗證、miRNA表達分析、單細胞基因表達分析等。
數(shù)字PCR是一種核酸分子絕對定量技術。當前核酸分子的定量有三種方法，光度法基于核酸分子的吸光度來定量；實時熒光定量PCR（Real Time PCR）基于Ct值，Ct值就是指可以檢測到熒光值對應的循環(huán)數(shù)；數(shù)字PCR是最新的定量技術，基于單分子PCR方法來進行計數(shù)的核酸定量，是一種絕對定量的方法。主要采用當前分析化學熱門研究領域的微流控或微滴化方法，將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應器或微滴中，每個反應器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個。這樣經過PCR循環(huán)之后，有一個核酸分子模板的反應器就會給出熒光信號，沒有模板的反應器就沒有熒光信號。根據(jù)相對比例和反應器的體積，就可以推算出原始溶液的核酸濃度。
PCR實際上是一個在模板DNA、引物（模板片段兩端的已知序列）和四種脫氧核苷酸等存在的情況下，DNA聚合酶依賴的酶促合成反應，擴增的特異性取決于引物與模板DNA的特異結合。
數(shù)字PCR（Digital PCR）儀器應用領域：
癌癥生物標志物研究和拷貝數(shù)變異分析以卓越的靈敏度和準確度測量癌癥突變的變異程度、
檢測稀有的 DNA 靶拷貝以及解析拷貝數(shù)變異狀態(tài)。
病原體檢測
精確地對靶 DNA 或 RNA 分子中的細微變化進行定量分析，從而檢測和監(jiān)測病原體。
與新一代測序 無縫對接
無需使用標準曲線，直接對 NGS 庫執(zhí)行絕對定量分析。
基因表達分析
可對少量 mRNA 和 miRNA 的細微變化進行準確及重復性極佳的檢測。
環(huán)境監(jiān)測
使用 QX200 系統(tǒng)可測試多種環(huán)境樣品，例如土壤和水。
食品檢測
采用經過驗證的 ddPCR 方法對轉基因生物體 （GMO） 進行評估。
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